EpiLinux

Enlaces a la versión 2.0

2012-01-16T10:23:00.001+01:00

Respondiendo a alguna cuestión que ha surgido comentaros que, aunque estamos volcados con la preparación de la versión 3, todavía están operativos los enlaces de la versión 2.0

URL: http://217.124.244.63/epilinux/epilinux2.zip

Torrent: http://tinyurl.com/843tzlh

También podéis encontrarlo en The Pirate Bay: http://thepiratebay.org/search/epilinux/0/99/0

Un Saludo,
Miguel.

Comienza la preparación de la nueva versión (3.0)

2011-11-21T12:45:00.000+01:00

Hace ya algún tiempo acometimos la actualización de la versión 2.0 de EpiLinux. Nuestra idea inicial era publicar la versión 2.1 con unas actualizaciones menores pero dada la envergadura de los cambios que está sufriendo la nueva versión, hemos decidido saltar directamente a la 3.0

Además de los cambios de rigor (actualización de versiones y repositorios, inclusión de nuevas funcionalidades, ...) estamos preparando una revisión completa del interface gráfico.

Queda, pues, anunciado oficialmente el inicio del desarrollo de la nueva versión 3.0

Cualquier sugerencia será bienvenida (y agradecida).

Un Saludo,
Miguel Rodríguez
Coordinador del Proyecto EpiLinux

El Software libre en la investigación médica

2011-05-18T12:00:00.002+02:00

Nos complace anunciar la inminente publicación del artículo "El software libre en la investigación médica" en Medicina Clínica Vol. 137 Nº 2 (11/6/2011).

http://www.elsevier.es/sites/default/files/elsevier/eop/S0025-7753%2809%2901562-0.pdf

Un Saludo,
Miguel.

Disponible Epidat 4 (Final)

2011-04-14T09:51:00.002+02:00

Epidat es un programa de libre distribución desarrollado por el Servizo de Epidemioloxía de la Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública de la Consellería de Sanidade (Xunta de Galicia) con el apoyo institucional de la Organización Panamericana de la Salud (OPS-OMS).

Los objetivos de Epidat son:

- Aportar una herramienta de manejo sencillo y de utilidad para el análisis estadístico y epidemiológico de datos que cubra algunas lagunas en las aplicaciones más extendidas.

- Apoyar y facilitar la docencia en epidemiología, tanto en el ámbito de la cooperación técnica como en el universitario.

- Fortalecer la capacidad analítica de los profesionales de salud.

- Ofrecer una fuente de formación autodidacta en determinadas áreas escogidas de la estadística aplicada a la epidemiología.

Más Info y descarga:
http://www.sergas.es/MostrarContidos_N3_T01.aspx?IdPaxina=62713

Un Saludo,
Miguel.

Versión 2.1

2011-02-14T13:43:00.002+01:00

Hola a tod@s.

Estamos trabajando para publicar la versión 2.1
En ella se incluye Epidat 4 en su versión definitiva, además de LibreOffice (como alternativa al Openffice recientemente adquirido por Oracle) y todos los repositorios y paquetes actualizados a sus últimas versiones.

En breve anunciaremos su disponiblidad.

Un Saludo,
LeugimSan.

Nuevo Dominio

2011-02-14T13:41:00.001+01:00

Hola a tod@s.

Desde ya, el proyecto EpiLinux tiene nuevo nombre de dominio:

http://www.epilinux.eu

Un Saludo,
LeugimSan.

EpiLinux en las Redes P2P

2010-12-15T09:41:00.002+01:00

Hola a tod@s.

Ya está disponible la descarga de EpiLinux 2.0 desde la red Torrent.
http://thepiratebay.org/torrent/6040477

Animamos a compartirlo y, así, contribuir a aumentar la velocidad de descarga.

Un Saludo,
Miguel.

Publicada la versión 2.0 de EpiLinux

2010-12-01T10:35:00.003+01:00

Ya ha sido publicado EpiLinux 2.0 y está disponible para su descarga desde http://www.sergas.es/MostrarContidos_N3_T01.aspx?IdPaxina=50178

Esperamos que os resulte de utilidad y os animamos a que compartáis con nosotros vuestros comentarios y sugerencias.

Un saludo,
el Equipo de Desarrollo.

La nueva versión disponible en breve

2010-11-09T13:53:00.002+01:00

Hola a tod@s:

En unos días estará disponible la versión 2.0 para su descarga desde la web de la Dirección General de Salud Pública de la Xunta de Galicia (http://dxsp.sergas.es) y desde la Oficina de Software Libre de la Universidad de Santiago de Compostela (http://www.usc.es/osl)

Estamos ultimando los detalles finales.

Un Saludo,
Miguel.

Diseño del DVD de EpiLinux 2.0

2010-10-19T14:40:00.004+02:00

Hola a tod@s.

Ya tenemos cerrado el diseño del DVD.

Un Saludo,
Miguel.

Noticia publicada en Mancomún (en gallego)

2010-10-07T13:22:00.000+02:00

http://www.mancomun.org/no_cache/actualidade/detalledenova/nova/epilinux-estara-presente-na-xxviii-reunion-cientifica-da-sociedade-espanola-de-epidemioloxia/

EpiLinux en la XXVIII Reunión Científica de la Sociedad Española de Epidemiología.

2010-09-15T11:39:00.002+02:00

EpiLinux 2 será presentado oficialmente en Octubre en la XXVIII Reunión Científica de la Sociedad Española de Epidemiología (http://www.geyseco.es/epidemiologia2010/)

Igualmente, se presentará EpiMeta. Un metapaquete basado en EpiLinux.

A partir de esa fecha estará disponible para su descarga.

Un Saludo,
Miguel.

Fondo de Escritorio para la Versión 2

2010-07-15T11:17:00.002+02:00

Hola a tod@s.

Ya tenemos cerrado el diseño del fondo de escritorio para la nueva versión de EpiLinux.

Un Saludo,
Miguel.

Noticias sobre EpiLinux

2010-04-26T08:39:00.003+02:00

Mancomún:
http://www.mancomun.org/no_cache/actualidade/detalledenova/nova/a-ubuntu-usc-e-epilinux-caminaran-da-man/

Código Cero:
http://www.codigocero.com/A-OSLUSC-colabora-no

2010-04-15T14:28:00.008+02:00

La OSLUSC (Oficina de Software Libre de la Universidad de Santiago de Compostela) está colaborando en la versión 2 de EpiLinux que desarrolla la Dirección Xeral de Saúde Pública e Planificación de la Consellería de Sanidade (Xunta de Galicia) y la Unidad de Bioestadística de la Facultad de Medicina (USC).

En estos momentos estamos inmersos en el rediseño de la imagen (logos, colores, fondos, splash, bootsplash, ..)

Os adjunto el nuevo logo de EpiLinux.

Un Saludo,
Miguel.

Pd.- Gracias Keko, Fran, Denís....

OSLUSC -> http://www.usc.es/osl/
DXSP -> http://www.galiciasaude.es/dxsp

2010-02-23T10:59:00.002+01:00

Tod@s los que queráis participar en la nueva versión 2 de EpiLinux, podéis hacerlo enviando vuestros comentarios, sugerencias, aportaciones, ... al email: soporte.epilinux@sergas.es

Ánimo!

Un saludo,
Miguel.

EpiLinux v2

2010-02-17T11:59:00.001+01:00

Hola a tod@s.

Desde principios de año estamos en pleno desarrollo de la versión 2 de EpiLinux. Por ahora estámos en fase Alpha. Os iremos informando de las novedades y cambios de esta versión.

Un Saludo,
Miguel.

I Conferencia R-Project Hispana

2009-12-11T13:22:00.001+01:00

Aquí tenéis los videos de las presentaciones:

http://tv.um.es/serial/index/id/216

Un Saludo,
Miguel.

I Conferencia R-Project Hispana

2009-11-23T15:13:00.002+01:00

La I Conferencia R-Project Hispana tendrá lugar los días 26 y 27 de Noviembre, en la Facultad de Informática de la Universidad de Murcia.

El Viernes 27, a las 10:30h, se presenta la ponencia "Estudios (bio)estadísticos con software libre: R y EpiLinux".

Será retransmitida en directo por streaming de video.

Más información: http:/www.ereros.org

Un Saludo,
Miguel.

IX Congreso Galego de Estatística e Investigación de Operacións

2009-11-03T14:01:00.002+01:00

El Viernes 13 de Noviembre, se presenta la comunicación oral "Realización de Estudios Bioestadísticos con software libre: EpiLinux".

http://www.ixsgapeio.uvigo.es/

EpiLinux en la XII Conferencia Española de Biometría

2009-09-17T07:48:00.002+02:00

Del 23 al 25 de Septiembre, se desarrolla en Cádiz la XII Conferencia Española de Biometría (http://ceb2009.uca.es/).

En la sesión póster del Viernes 25 se presenta "EpiLinux: realización de estudios bioestadísticos".

Nos vemos en Cádiz.

Presentación en la WhyFLOSS Conference 2009 (Madrid)

2009-06-22T14:46:00.001+02:00

Video:
http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/video/171

Presentación (en PDF):
http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/getpdf/171

Abstract:
http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/program/171

Fotos:
http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/event_resources/events/WFC-MAD-0905/images/gallery/Ponentes/DSCN0223.jpeg

http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/event_resources/events/WFC-MAD-0905/images/gallery/Ponentes/DSCN0212.jpeg

http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/event_resources/events/WFC-MAD-0905/images/gallery/Ponentes/DSCN0219.jpeg

http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/event_resources/events/WFC-MAD-0905/images/gallery/Ponentes/DSCN0237.jpeg

Un Saludo,
Miguel.

Dudas de un usuario de Ubuntu

2009-04-30T08:52:00.000+02:00

Hola Carlos:

El proceso de "montaje del software" de la distro EpiLinux es algo laborioso puesto que no todos los paquetes seleccionados son triviales de instalar, con lo que resulta imposible obtenerlos todos directamente con un apt-get; además de que algunos no se encuentran en los repositorios por defecto.

Si lo que quieres es instalar R (y sus packages) deberás añadir manualmente el repositorio adecuado (puesto que, los repositorios por defecto de Ubuntu incluyen un número reducido de paquetes de R); para ello edita el fichero /etc/apt/sources.list y añádele una de estas lineas (dependiendo de la distro de Ubuntu que tengas instalada).

deb http:///bin/linux/ubuntu jaunty/
deb http:///bin/linux/ubuntu intrepid/
deb http:///bin/linux/ubuntu hardy/
deb http:///bin/linux/ubuntu dapper/

Obviamente has de sustituir por la dirección del mirror CRAN que utilices. En el caso de Epilinux, quedaría así (con el CRAN de Red Iris en España):
deb http://cran.es.r-project.org/bin/linux/ubuntu hardy/

Puede que para instalar determinados paquetes de R, necesites que tu distro se descargue software del repositorio backports.. . (por ejemplo, si necesitamos Tcl/Tk) para ello debieras añadirle a /etc/apt/sources.list la siguiente linea: deb http://cran.es.r-project.org/bin/linux/ubuntu hardy/ hardy-backports main restricted universe.

Después de esto, la continuación es trivial (ahí va un ejemplo):

sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install r-base-dev
sudo apt-get install Rcmdr

Para el caso de QuantumGIS, hemos de añadir (por el mismo método explicado para R) el repositorio deb http://ppa.launchpad.net/qgis/ubuntu hardy main.

Otro tema es el caso de PSPP... El GUI se llama PSPPIRE y hay que instalarlo manualmente (tendría que comprobar si en la última versión ya no es necesario)... Aunque creo que por ahí existe ya un paquete debianizado de PSPPIRE. Para instalar las dependencias debemos hacer un:

sudo apt-get install autoconf automake1.9 gnulib gettext gettext-base texinfo smake build-essential pkg-config subversion subversion-helper-scripts subversion-tools libgsl0 libgsl0-dbg libgsl0-dev libperl5.8 perl perl-base perl-modules libncurses5 libncurses5-dbg libncurses5-dev libreadline5 libreadline5-dbg libreadline5-dev libplot2c2 libplot-dev libplotutils libgtk2.0-dev libgtk+2.0-directfb-dev libglade2-dev cvs libcvsservice0 gcvs

después de esto ya podemos descargarlo (desde cvs)

cvs -z3 -d:pserver:anonymous@cvs.savannah.gnu.org:/sources/pspp co pspp
cvs -z3 -d:pserver:anonymous@cvs.savannah.gnu.org:/sources/gnulib co gnulib

e instalarlo

cd pspp
make -f Smake
./configure
make
sudo make install

Para otro tipo de software (por ejemplo WinBUGS) necesitaremos instalar y configurar WINE (puesto que son aplicaciones para Windows).

No me enrrollo más, espero que esto haya contestado (aunque sea parcialmente) a tu pregunta.

Ah, una cosa más... veo que tu empresa está ubicada en Madrid, te informo de que el próximo 21 de Mayo estaré por ahí en la WhyFLOSS Conference 2009 (http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/program) con un ponencia sobre EpiLinux (diculpad la propaganda poco-subliminal).

Un Saludo,
Miguel A. Rodríguez.
http://www.galiciasaude.es/dxsp

-----Mensaje original-----
De: Carlos J. Gil Bellosta
Enviado el: martes, 28 de abril de 2009 1:16

Hola, ¿qué tal?

¿Sería posible bajarse a un Ubuntu con Gnome los paquetes específicos de análisis que tenéis en EpiLinux?

Quiero decir, tenéis una lista de manera que yo ejecute

apt-get install [la lista]

y ya tenga todos los paquetes en cuestión instalados en mi Ubuntu?

Un saludo,

Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com

EpiLinux en la WhyFLOSS Conference 2009

2009-04-23T07:54:00.002+02:00

El día 21 de Mayo, en la WhyFLOSS Conference 2009 (Madrid).
http://www.whyfloss.com/es/conference/madrid09/program

Hora: 15:30
Lugar: Universidad Carlos III. Campus de Leganés.

Conferencias gratuitas de tecnologías abiertas de IT en Madrid

En el mes de Mayo de este año se está realizando la 7ta edición de la WhyFLOSS Conference, con entrada LIBRE y GRATUITA y con CERTIFICADOS DE ASISTENCIA y PONENCIA. Un evento internacional organizado por Neurowork que se realiza en España y Argentina y que esta vez se realizará por segunda vez en la ciudad de Madrid.

Con un importante apoyo de la Universidad Carlos III, campus Leganes y el Grupo de Usuarios de Linux UC3M se presentarán conferencias variadas entorno a las tecnologías abiertas de IT.

Se encuentra abierta la INSCRIPCION ON-LINE GRATUITA y también el PATROCINIO.

Problemas de actualización con Adept

2009-02-05T13:16:00.002+01:00

Puede darse el caso de que, al ejecutar alguno de los programas de actualización de EpiLinux (como el "Agregar y quitar programas" del menú principal o el "Gestor Adept" del menú "Sistema"), nos aparece un error (del tipo, Data base locked-actualizador adept. Another proces is using the packaging system database. Pleased close the other application before using this one) y no nos permite continuar.

Eso pasa cuando una instalación/actualización no se completó y bloquea la base de datos. Por ejemplo, suele pasar al actualizar el paquete "flashplugin-nonfree" porque durante la instalación hay que aceptar la licencia de Adobe, y Adept no muestra la consola con el diálogo a no ser que seleccionemos "detalles" mientras se está actualizando.

Para solucionarlo, abriremos una ventana de terminal (Sistema, Konsole) y ejecutaremos el siguiente comando:

sudo dpkg --configure -a

Esta orden ejecuta el comando "dpkg" (http://es.wikipedia.org/wiki/Dpkg) en modo "superusuario" (http://es.wikipedia.org/wiki/Sudo).

Un Saludo,

LeugimSan.

Qué hacer con el fichero .ISO ?

2009-01-29T10:27:00.002+01:00

Una vez descargado el fichero EPILINUX.ZIP desde la URL http://www.sergas.es/epilinux, es necesario descomprimirlo y nos aparecerá un archivo llamado EPILINUX.ISO.

Este fichero es una imagen de DVD.

Para poder utilizarla es necesario que, con nuestro software de grabación preferido, grabemos esa imagen en un DVD. Ojo! es necesario grabarlo con la opción de grabar/quemar imagen a un disco y no con la opción de crear un DVD de datos, porque lo que pretendemos es preparar un Live-DVD, que arranque luego el sistema.

Una vez que hemos conseguido grabar el DVD, basta con reiniciar el equipo e indicarle que arranque desde la unidad donde tenemos el DVD de EpiLinux.

Un Saludo,
Leugim San.

Feliz 2009

2008-12-29T10:38:00.000+01:00

El equipo de trabajo de EpiLinux os desea a tod@s un Feliz 2009.

Un saludo,
LeguimSan.

Empezando...

2008-12-03T09:45:00.005+01:00

Os adjunto un correo que puede que conteste alguna pregunta a los que estéis empezando con EpiLinux...

De: Rodríguez Muíños, Miguel Ángel
Enviado el: viernes, 28 de noviembre de 2008 11:28
Para: [oculto]
Asunto: RE: [msp2002_03] blog de EpiLinux

Estimada Gemma:

Muchas gracias por tu interés y por haber contactado con nosotros. Estaremos encantados de ayudarte en lo que modestamente podamos.

Te comento que, una vez descargado el fichero EpiLinux.ISO, el siguiente paso es "quemarlo" en un DVD.. es decir; utilizar un programa de grabación (Nero, Alcohol 120%, .. o similar) e indicarle que vas a grabar una imagen ISO a un DVD.

Una vez que hemos completado este paso tendremos en nuestro poder un DVD de EpiLinux listo para ser utilizado.

Ahora sólo queda meterlo en el ordenador e indicarle que arranque desde la unidad de CD/DVD (este proceso cambia para los distintos tipos de equipos).

Una vez que el EpiLinux arranca, ya tenemos el entorno gráfico cargado ylisto para trabajar.

Como puedes observar, hay ciertos iconos en la pantalla, que son accesos directos a programas... A la izquierda: Firefox (que es un navegador web), un procesador de textos, hoja de c+laculo, ... A la derecha: PSPP (que es un software alternativo al SPSS), R, Octave (alternativa libre al MatLab), ...

Aunque el entorno gráfico es KDE (en su versión 3), es muy similar al interface del Windows (por si te vale de referencia).

Por tu pregunta, supongo que ya habrás llegado hasta aquí... ahora intentaré responderte a tu duda: Así como Windows monta sus sistemas de archivos detro de la Unidad C: (el disco duro).. los sistemas Linux lo hacen diretamente en un sistema de archivos y carpetas, donde la rama más alta es / (el directorio raíz) y de ahí cuelgan las demás carpetas.. etc, bin, sbin, home, ...

A diferencia de Windows, en Linux los archivos y carpetas se organizan de manera diferente, en Windows cuando instalamos un programa se crea una carpeta donde estarán todos los archivos del programas, en Linux en cambio, la idea es agrupar en carpetas archivos con fines similares, es decir en un sectores todos los ejecutables, en otro las librerías, en otro las configuraciones, etc.

* /: Esta es la raíz.

* /usr: Aquí se encuentra la gran mayoría de los archivos existentes en un sistema Linux, como documentación, ejecutable, etc.

* /bin: Aquí están los comandos que pueden usar todos los usuarios (incluido el root).

* /sbin: Aquí están los comandos que sólo puede usar el root.

* /dev: Aqui están todos los dispositivos de nuestra máquina.

* /home: Lugar donde se almacenan las cuentas de usuarios. Algo parecido a como es “mis documentos” en Windows.

* /lib: Aquí están las librerías que se necesitan para el sistema.

* /var: Contiene información variable, como por ejemplo los logs del sistema (/var/log), correo local, etc.

* /tmp: Directorio temporal.

* /etc: Aquí se encuentran todas las configuraciones. Por ejemplo si queremos modificar la configuración de Samba tan solo hay que editar el archivo de texto /etc/samba/smb.conf

* /root: Cuenta del administrador.

* /boot: Aquí está todo lo relacionado con el arranque del sistema.

* /media: Punto de montaje para sistemas de archivos montados localmente.

* /mnt: Es el predecesor de /media, se lo conserva solo por razones históricas

* /proc: Sistema de archivos virtual de información de procesos y del kernel.

Casi todas las carpetas que te puedes encontrar en esa estructura pertenecen al sistema y no debiera ser necesario tocarlas. Simplemente has de fijarte en la carpeta HOME. dentro de ella se encuentra la carpeta EPILINUX (que es como la carpeta "mis documentos" de Windows).

No hemos considerado necesario realizar un manual (en papel) de manejo y utilización de EpiLinux, puesto que existe inmumerable información en Internet al respecto (y el software incluido en esta distribución tiene sus propios manuales). Por lo que te aconsejamos que busques información sobre manuales básicos de linux, del entorno gráfico KDE (versión 3) y de cada uno de los programas que te interesa utilizar.

Si necesitas más información sobre cualquier aspecto relacionado con EpiLinux, no dudes encontactar con nosotros.

Recibe un cordial saludo,
Miguel.

Bienvenida

2008-11-20T11:19:00.001+01:00

Bienvenidos al blog de EpiLinux.

EpiLinux es un Sistema Operativo, de libre distribución, especialmente orientado a la utilización de herramientas de análisis epidemiológico y bioestadístico.

EpiLinux es una distribución completa de Linux. Está basado en Ubuntu y Debian GNU/Linux, con entorno de escritorio KDE, en la que se ha incluido, entre otros programas, una recopilación de software para la realización de estudios de salud: desde herramientas ofimáticas (OpenOffice, ...), software de Internet (Firefox, ...) hasta programas específicos de bioestadística, de análisis de datos y epidemiológicos (PSPP, R, SciLab, Octave, QGIS, EpiGrass, ...)

Como complemento al software nativo, EpiLinux dispone del emulador WINE, que permite ejecutar software diseñado para Windows en su propio entorno. Funciona como un “cargador” para Linux de programas basados en las API Win16 y Win32.

EpiLinux se puede utilizar como un sistema “ Live” y ejecutar directamente desde el CDROM evitando, así, la interacción con instalaciones previas de otros Sistemas Operativos. También se puede instalar en el disco duro del equipo.

Para cargar EpiLinux basta con indicarle al equipo que arranque desde la unidad de CD/DVD. Una vez que se ha iniciado el sistema, desde el menú principal, podemos elegir entre utilizar la versión "live" o instalarlo en disco.
La imagen .ISO de la última versión de EpiLinux, se puede descargar, gratuitamente,desde la Web de la Dirección Xeral de Saúde Pública, en el apartado de “Aplicacións e Datos”.

http://dxsp.sergas.es/

Enlace directo

Este software se distribuye bajo licencia GNU GPL . Animamos a copiarlo y compartirlo libremente.

Contacto: soporte.epilinux@sergas.es